API Reference

Neurodocker generates containers for neuroimaging.

It includes ReproEnv, which is an extensible, generic container generator.

Subpackages

• neurodocker package
  • Subpackages
    • neurodocker.reproenv package
      • Submodules
        • neurodocker.reproenv.exceptions module
          • RendererError
          • ReproEnvError
          • RequirementsError
          • TemplateError
          • TemplateKeywordArgumentError
          • TemplateNotFound
        • neurodocker.reproenv.renderers module
          • DockerRenderer
            • DockerRenderer.add()
            • DockerRenderer.arg()
            • DockerRenderer.copy()
            • DockerRenderer.entrypoint()
            • DockerRenderer.env()
            • DockerRenderer.from_()
            • DockerRenderer.install()
            • DockerRenderer.label()
            • DockerRenderer.render()
            • DockerRenderer.run()
            • DockerRenderer.user()
            • DockerRenderer.workdir()
          • SingularityRenderer
            • SingularityRenderer.arg()
            • SingularityRenderer.copy()
            • SingularityRenderer.entrypoint()
            • SingularityRenderer.env()
            • SingularityRenderer.from_()
            • SingularityRenderer.install()
            • SingularityRenderer.label()
            • SingularityRenderer.render()
            • SingularityRenderer.run()
            • SingularityRenderer.user()
            • SingularityRenderer.workdir()
        • neurodocker.reproenv.state module
          • get_template()
          • register_template()
          • registered_templates()
          • registered_templates_items()
        • neurodocker.reproenv.template module
          • Template
            • Template.alert
            • Template.binaries
            • Template.name
            • Template.source
        • neurodocker.reproenv.types module
          • TemplateType
            • TemplateType.alert
            • TemplateType.binaries
            • TemplateType.name
            • TemplateType.source